一つ、またはそれ以上のNucleusCMSのインストール(アップグレード)用ファイルがサーバ上に残っている、もしくは書き込み可能になっています。
これらのファイルを削除、またはパーミッションを変更してセキュリティを確保してください。Nucleusが見つけたファイルのいくつかを次に示します。
この警告を表示させたくない場合は、globalfunctions.phpの$CONF['alertOnSecurityRisk']の値を0にするか、同様の内容をconfig.phpの最後に記述します(セキュリティレベルが下がります)